Da die Lichtduschen keinerlei infrarote oder ultraviolette Strahlung abgeben, sind in der Regel auch keine Nebenwirkungen bei der Anwendung der Lichttherapie zu beobachten. In seltenen Fällen können leichte Kopfschmerzen oder Schlaflosigkeit auftreten, vor allem zu Beginn der Behandlung. Indem man die Dauer der Sitzungen und den Abstand zwischen zwei Sitzungen verkürzt, können diese wenig bedeutenden Nachteile beseitigt werden.